По умолчанию Emacs не отображает номера строк, хотя прекрасно это умеет, и оставляет после себя файлы с резерными копиями редактируемых файлов, даже когда конечная версия файла сохранена.

Я выхожу из положения следующим образом: создаю файл ~/.emacs с таким содержимым

(setq make-backup-files nil)
(add-hook 'after-change-major-mode-hook' display-line-numbers-mode)

Первая строка предписывает emacs'у удалять резервную копию редактируемого файла после сохранения последних изменений. Вторая строка включает отображение номеров строк.